《仙侶情緣》的故事發生在南宋時期金國第二次大舉南侵的三年以后。故事承接一代，南宋大將軍、“飛劍客”張風之子張如夢與金國國師、“天劍客”南宮滅之女南宮彩虹由仇敵成為愛侶（見《劍俠情緣》劍門關一段），二人遠走漠外，不問世事，一晃二十年。其子南宮飛云已經長大成人，年滿16歲，文才武功都有了幾分火候。為了兒子的前途，夫婦二人決定讓兒子離開大漠，去尋找姑父獨孤劍（仙劍客獨孤云之子）、姑母張琳心，希望在姑父姑母的教導下逐漸融入社會。天資聰穎卻又完全不諳世事的南宮飛云就這樣踏入一個他完全陌生的世界，具有漢金血統的南宮飛云卻又因為父母的原因為宋金兩國所不容。在大漠里生活了16年的南宮飛云對一切都充滿了好奇，因為好奇，意外救了一位美麗的少女。優先次見到的美麗少女自然就是他的夢中情人！然而，這位直到好久以后才知道叫若雪的女孩，身份卻撲朔迷離，且行蹤詭秘。
    其時宋金南北對峙，局勢如同水火。但沒有任何世界觀的南宮飛云完全無視這一切，他的心中只有一個人，走遍天涯海角也要找到她。在尋找心上人的途中，我們的主人公結識了一個又一個的朋友，也遇到了一個又一個的敵人。刻骨的思念，真摯的友情，艱苦的路途，險惡的機關，撲朔迷離的線索，恩怨纏綿的江湖，伴隨著南宮飛云從一個陷阱走向另一個陷阱。起伏跌宕的故事，性格豐滿的人物，懸念迭起的進程，幽默輕松的對白，《仙侶情緣》將以喜劇的手法描寫一出時代的悲劇。與一代相比，二代無論是在美工、操控還是音樂都達到了一個新的高度，在情節及人物角色表現方面，遵循了一代的風格，諸多先進技術的運用也使得人物形象更加飽滿。在圖形方面，《仙侶情緣》的引擎以640×480分辨率16位真彩色的45度角地圖給玩家展現一個精美細膩的世界；在提高/增加地圖素質的同時現有的引擎也實現了超大地圖功能，單幅地圖很大可達267屏；人物在地圖上可以八方向行走，屏幕以像素為單位卷動，滾動異常平滑；改良后的象素級即時光影作用使光影的變化異常平滑；人物動作非常細致，一個普通npc就擁有七種不同的動作，總動畫幀數在1000幅以上，而主角則會有包括跑動在內的多達十余種的動作。在《仙侶情緣》的美術制作中，npc的制作的重中之重，西山居在制作npc方面投入了大力的人力物力，也獲得了相應的收效，在《仙侶情緣》中預計總共會出場200余個形態動作各異的npc，全部采用3d建模16位高彩著色，每個戰斗類npc至少有6個八方向動作而城鎮類npc有至少有3個八方向動作，每個動作的動畫數平均在15幀上下，而復雜動作的動畫數更高達25幀以上，提高/增加了npc動作的流暢平滑。在戰斗方面，《仙侶情緣》的引擎實現了即時戰斗系統，可以在地圖上進行8方向普通攻擊和32方向特殊攻擊；不錯的人工智能，不僅具有不錯的路徑搜索方法，而且給npc引入可視范圍、視角等多種屬性。